Neben den Akten der verschiedenen universitären Einrichtungen verfügt das Universitätsarchiv über zahlreiche universitätsgeschichtliche Sammlungen. Dazu gehören u.a. die Fotosammlung mit ca. 3.000 Bildern und eine Sammlung von Zeitungsausschnitten zu ca. 4.500 Personen. Hinzu kommen Sammlungen von Flugblättern und Plakaten, von studentischen Zeitschriften sowie zahlreiche kleinere Sammlungen zu unterschiedlichen universitätsgeschichtlichen Themen.
Zu den Sammlungen zählen auch die rund 40 Nachlässe Mainzer Professoren und anderer Universitätsangehöriger. Besonders zu erwähnen sind die Nachlässe des Historikers Leo Just, des Pädagogen Erich Feldmann, die Botanikers Wilhelm Troll und des Musikwissenschaftlers Arnold Schmitz.
Einen Überblick über die einzelnen Sammlungen finden Sie auch auf der Homepage des Universitätsarchivs. Die Nachlässe sind zudem über die Nachlassdatenbank des Bundesarchivs recherchierbar.